東涌互通立交至與海鷗島互通立交段按次計費，每標準車為18元；

海鷗島互通立交至沙田互通立交段按次計費，每標準車為24元。

通行本項目全程，標準小客車通行費為42元，其中，貨車實行完全計重收費。